Tras el viaje de estudios a Kioto, la clase de 3.º-A vuelve a la rutina habitual dela Academia Mahora… Pero los problemas no terminan: Asuna sueña con Negiy su padre, y el pequeño maestro decide entrenar para mejorar sus habilidades con la ayuda de sus alumnas. Debe hacerlo sin que las chicas descubran que tiene poderes mágicos, algo que poca gente sabe, pero una delas que sí lo saben es Asuna. Será precisamente a ella a quien le revelará un secreto sobre su padre, Nagi, y qué relación hay entre el Thousand Master y lachica.
