Si deseas proteger lo que aprecias, debes luchar con uñas y dientes.No mucho después de que Segami sea testigo de cómo las fuerzas de autodefensa lanzan un ataque suicida contra los extraterrestres en un acto desesperado de desafío, recibe noticias de su madre que fortalecen su determinación de luchar también. Con los Small 3 a cuestas, Segami se une al grupo insurreccional Rebelion y se adelanta a sus camaradas en miniatura para participar en la Misión Shibuya liderada por tropas guerrilleras contra los invasores. Mientras tanto, Futaba despierta de su letargo a bordo de la nave alienígena, solo para encontrarse rodeada de soldados armados que la atacan sin previo aviso, ¡obligándola a enfrentar por fin la amenaza alienígena!
